◆发表要点
- •使用下一代DNA测序器对早生树刺槐进行了网罗性基因分析。
- •高分辨率解读了转录因子等基因组编辑所需的目标碱基序列。
- •鉴定了耐病性、耐盐性等育种和新品种选拔所需的标记序列。
- •开发以碳中和生物质发电为目标的早生树分子育种技术。
冈山大学学术研究院环境生命自然科学学域(农)的田村隆教授和住友林业株式会社筑波研究所小组,实施了在早生树刺槐(Acacia crassicarpa)发现的遗传基因的网罗性解析。本研究成果于8月29日在瑞士植物科学专业杂志「Frontiers in Plant Science」上刊登为Original Research Article。
早生树刺槐是5年建成森林的豆科树木,是在东南亚和澳大利亚野生的天然生物质资源。作为发电燃料用途开发被期待,不过,由于钾含量高,燃烧产生强碱性且粘着性高的灰,使燃烧炉的传送带破损等,在育种上有几个改善课题。到目前为止,树木的育种花了几个世纪等待优良品种的出现,只能花很长时间反复选拔。本研究网罗性地解读了刺槐培养细胞中的表达基因。如果碱序列的解读成功的话,就可以设计基因组编辑所需的目标序列,所以很有可能在短时间内改良树木的品种。
这次,新解读的93317个基因,提供了开创早生树刺槐分子育种的学术基础。另外,在选拔优良种的基础上,还鉴定了具有用于识别个体的标记序列的转录因子基因群。根据这个排列信息可以在分子水平上识别优良品种。
◆研究者寄语
像在初春微弱的阳光下也能旺盛生长的莲花一样,豆科植物通过与氮固定细菌共生,从大气中吸收了碳固定的限速氮。早生树刺槐也是豆科树木。作为惊人的成长速度的一个原因,也许是在树木的某个地方隐藏着氮固定生物。早生树刺槐在种植园中大规模栽培并被产业利用,但在学术上留下了很多谜团。本研究公开的洋槐遗传基因目录,有望提供揭开这种秘密的智力基础。 | ![]() 田村教授 |
■论文信息
论 文 名:Illumina-based transcriptomic analysis of the fast-growing leguminous tree Acacia crassicarpa: functional gene annotation and identification of novel SSR-markers
刊登杂志:Frontiers in Plant Science
著 者:Ishio, S. Kusunoki, K., Nemoto, M., Kanao, T., Tamura, T.
D O I:10.3389/fpls.2024.1339958
U R L:https://www.frontiersin.org/journals/plant-science/articles/10.3389/fpls.2024.1339958/full
■研究资金
本研究是受住友林业株式会社共同研究及科学技术振兴机构的目标驱动型研究开发的可适应且无缝的技术转移程序(A-STEP,JPMJTM20QX21445979)的支持而实施的。
<详细研究内容>
早生树刺槐的网罗性表达基因的解读和育种标记序列的鉴定~5年建成森林的豆科树木的网罗性表达基因的解读和育种〜
<咨询>
冈山大学 学术研究院环境生命自然科学学域
教授 田村 隆
(电话)086-251-8293
(FAX)086-251-8388